研究报告

石榴 POD 基因家族鉴定及生物信息学分析  

冯立娟1 , 史作亚2 , 杨雪梅1 , 唐海霞1 , 焦其庆1 , 尹燕雷 1*
1 山东省果树研究所, 泰安, 271000; 2 济南园林开发建设集团有限公司, 济南, 250001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2019年04月19日    接受日期: 2019年04月26日    发表日期: 2020年05月28日
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摘要

为解析石榴 POD 基因家族的特征,本研究利用生物信息学技术对石榴 POD 基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、二级结构、亚细胞定位、系统进化关系和保守基序等进行了预测分析。结果表明,石榴中共鉴定出 107 POD 基因家族成员,其大部分为碱性蛋白、稳定蛋白和亲水性蛋白。蛋白二级结构以 α- 螺旋和无规则卷曲结构为主要构成元件。亚细胞定位表明 POD 蛋白主要分布在细胞质中。根据系统进化关系可分为 11 个亚族,每个亚族基因的数量不同,第 5 个亚族最多。聚在同一亚族 POD 蛋白的保守基序组成相似,其进化关系较近。研究结果为深入分析石榴 POD 基因的功能,揭示其调控石榴果实褐变的机理提供了科学依据。
 

关键词
石榴(Punica granatum);过氧化物酶;基因鉴定;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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