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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 2 篇
收稿日期: 2019年03月22日 接受日期: 2019年04月25日 发表日期: 2020年04月30日
棉花黄萎病是制约棉花产业健康发展的一种重要病害,在生产上未发现有效的根治办法,使用现代基因工程技术,从基因库中挖掘抗黄萎病相关基因,为棉花抗黄萎病育种工作的提供理论基础。本研究根据在 GenBank 中检索到抗黄萎病基因 SDAHP (GU479467, 1,3- 脱氧 - 阿拉伯庚酮糖 -7- 磷酸合成酶),从陆地棉基因组数据库中检索到 3 个同源基因(NM_016893351.1, XM_016849738.1 和 XM_0168151150.1),根据3 个同源基因核苷酸序列设计引物,以陆地棉 cDNA 为模板进行克隆,获得 3 个目的基因,依次命名为GhDAHP-1、GhDAHP-2 和 GhDAHP-3。利用 ProtParam 和 Prot Scale 等在线软件对目的基因进行生物信息学分析;RT-PCR 分析黄萎病菌诱导后目的基因在陆地棉叶片中的表达量。结果表明:GhDAHP-1 序列全长1 983 bp,氨基酸总数为 539,分子质量约 59.45 378 kD,理论等电点 pI 为 8.7;GhDAHP-2 序列全长 1 832 bp,氨基酸总数 516,分子质量约 57.02 998 kD,理论等电点 pI 为 7.68;GhDAHP-3 序列全长 1 652 bp,氨基酸总数517,分子质量约 56.95 491 kD,理论等电点 pI 为 8.52。系统进化树分析,GhDAHP 与雷蒙德氏棉(Gossypium raimindii)、木本棉(Gossypium arboreum)的亲缘关系最近。棉花叶片在黄萎病菌的处理下,GhDAHP 基因表达量呈现先升高后降低的趋势,推测受到黄萎病诱导后,GhDAHP 基因可能参与了黄萎病菌侵染的防卫过程。