叶春秀 , 李有忠 , 庄振刚 , 谢宗铭

新疆农垦科学院分子农业技术育种中心, 作物种质创新与基因资源利用兵团重点实验室, 石河子, 832000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2014 年, 第 12 卷, 第 10 篇   doi: 10.13271/j.mpb.012.000909
收稿日期: 2013年11月05日    接受日期: 2014年03月15日    发表日期: 2014年08月07日

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推荐引用：

Ye C.X., Li Y.Z., Zhuang Z.G., and Xie Z.M., 2014, Comparation and Application of the Two Electrophoresis on SSR of Earliness Cultivars in Upland Cotton in Xinjiangt, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 12(5): 909-913 (叶春秀, 李有忠, 庄振刚, 谢宗铭, 2014, 两种电泳方法在分析新陆早系列品种SSR标记结果中的比较与应用, 分子植物育种, 12(5): 909-913)

为了研究两种电泳方法在新陆早系列材料SSR分析不同阶段使用效果的可行性，本研究利用2.5%琼脂糖凝胶和6%聚丙烯酰胺凝胶对新陆早系列材料SSR扩增结果进行检测。结果显示，两种电泳方式都能够得到较为清晰的扩增条带，但在获得的条带总数及多态性比率上有所差异。琼脂糖凝胶电泳共检测出30条条带，其中有18条为多态性条带，多态性比率为60%；而在聚丙烯酰胺电泳方法共检测出50条条带，多态性条带为33条，多态性比率为66%。基于两种电泳方法所获得的SSR标记位点，利用SPSS和PopGen32软件计算遗传相似系数，并构建遗传关系聚类图。分析结果显示，两种电泳方法所获得的聚类结果大致相同，在个别品种的分析结果上存在着一定程度上的差异。其中，聚丙烯酰胺凝胶获得的分析结果与实际遗传背景拟合性较好，所以，在最终的SSR标记分析过程中采用6%的聚丙烯酰胺凝胶进行分析效果更好，而琼脂糖凝胶电泳更加适合早期SSR标记引物的大量筛选。为新陆早系列材料SSR标记快速、准确分析提供了研究方法与技术支持。

SSR；两种电泳方法；比较；分析