研究报告

银杏(Ginkgo biloba) GbHsp20基因家族的鉴定及系统进化分析  

何福林 , 张斌*
1 湖南科技学院化学与生物工程学院, 湖南省银杏工程技术研究中心, 永州, 425199
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2019年03月20日    接受日期: 2019年04月22日    发表日期: 2020年03月20日
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摘要

Hsp20 (heat shock protein 20, Hsp20)是一个多样、古老和重要的基因家族,存在于所有植物中。Hsp20 有助于蛋白质折叠和防止不可逆的蛋白质聚集,从而赋予生物对高温的耐受性。银杏树是一种活化石,有自己独特的应激防御系统。但是,银杏中 GbHsp20 基因家族的研究目前还是一片空白。本研究借助银杏基因组数据库,以 ACD 结构域和分子量为基础,共鉴定了 39 GbHsp20 基因家族成员,并对其基因结构、基因组定位、系统发育关系和保守基序等特征进行了分析。本研究揭示了银杏和拟南芥 Hsp20 基因家族成员具有高度的同源性;虽然 39 GbHsp20 的基因结构存在差异,但蛋白序列高度保守,所有的 GbHsp20 中都含有基序 1 2;将 39 GbHsp20 分为 10 亚族,每个亚族内的成员具有相似的基序分布特征。这为进一步研究 GbHsp20 基因家族成员的生物学功能提供一定的参考依据,同时为银杏中其他基因家族研究提供指导。

关键词
银杏;Hsp20;生物信息学;系统发育;基因家族

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《分子植物育种》印刷版
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