研究报告

露地菊(Chrysanthemum×grandiflora) CgDREB 基因克隆和生物信息学分析  

杨伊如 , 王琳 , 杨柳慧 , 刘彧 , 周蕴薇
东北林业大学园林学院, 哈尔滨, 150000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2019年01月21日    接受日期: 2019年03月06日    发表日期: 2020年04月29日
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摘要

DREB 转录因子在植物抗逆过程中起关键性作用,它可以激活一系列抗逆功能基因的表达从而综
合提高植物的抗逆性。为探究露地菊
DREB 基因的功能,本研究通过结合 RNA-Seq RT-PCR 技术从露地
菊‘纽
9717’中克隆得到 CgDREB 基因,并对该基因及其蛋白进行生物信息学和表达模式分析。结果显示,
CgDREB 基因 ORF 全长 450 bp,编码 149 个氨基酸,预测蛋白相对分子量 16.742 kD,理论等电点 9.32,为亲
水性蛋白,没有跨膜结构,无信号肽。功能结构域分析表明其具有一个高度保守的
AP2/ERF 结构域。同源性
分析其属于
AP2/ERF 转录因子家族 DREB 亚组 A-5 组。蛋白质二级结构中无规则卷曲占 57.05%α- 螺旋
28.86%,延伸链占 10.07%β- 转角占 4.03%。三级结构显示其以单体蛋白结构存在。RT-qPCR 分析表明,
高盐、干旱、低温和
ABA 均能诱导 CgDREB 基因的表达。本研究为深入了解露地菊 A-5 DREB 转录因子及
其抗逆调控机制提供基础,为露地菊品种改良提供理论依据。

关键词
露地菊;DREB;基因克隆

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《分子植物育种》印刷版
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