研究报告

基于全基因组的番茄 YUCCA 基因家族生物信息学分析  

莫福磊 1* , 束艺2* , 陈秀玲2 , 刘卓凡3 , 孙妍2 , 姜珊2 , 李凤硕2 , 王傲雪 2**
1 东北农业大学生命科学学院, 哈尔滨, 150000; 2 东北农业大学园艺园林学院, 哈尔滨, 150000; 3 东北农业大学农学院, 哈尔滨, 150000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2019年04月04日    接受日期: 2019年04月11日    发表日期: 2020年05月28日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要

YUCCA 基因是植物在合成生长素过程中限速酶的编码基因,植物在生长发育过程中离不开生长素,也同样也离不开 YUCCA 基因。为深入研究番茄中的 YUCCA 基因,本研究利用生物信息学方法,在番茄全基因组范围内共鉴定出了 17 YUCCA 基因,并对 17 YUCCA 基因的基本信息、转录本结构、保守基序、顺式元件、染色体定位、系统发育以及表达模式进行了分析。结果表明,17 YUCCA 基因分布在 7 条染色体上,并且可以分为三大类 ABCYUCCA 基因的内含子在 0~7 之间分布。系统发育分析表明,同一条染色体上的 YUCCA 基因有明显的进化关系。通过以上分析,对后续深入研究番茄 YUCCA 基因家族提供了参考。
 

关键词
番茄(Solanum lycopersicum);YUCCA;生物信息学;基因家族

HTML格式版本正在制作中。
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
莫福磊 1*
.
束艺2*
.
陈秀玲2
.
刘卓凡3
.
孙妍2
.
姜珊2
.
李凤硕2
.
王傲雪 2**
相关论文
.
番茄(Solanum lycopersicum)
.
YUCCA
.
生物信息学
.
基因家族
服务
. 发表评论