研究报告

亚麻(Linum usitatissimum)铅胁迫转录组初步分析  

安霞 1* , 金关荣1 , 陈杰2 , 骆霞虹1 , 陈常理1 , 李文略1 , 朱关林1
1 浙江省萧山棉麻研究所, 浙江省农业科学院花卉研究开发中心, 杭州, 311251; 2 华中农业大学生命科学技术学院, 武汉, 430070
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2019年03月28日    接受日期: 2019年04月04日    发表日期: 2020年05月28日
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摘要

亚麻的不同器官具有多种商业价值。随着土壤重金属污染情况日益加剧,有必要对亚麻响应重金属污染的分子机理进行研究。本研究采用二代测序技术,对亚麻在铅胁迫下地上部位样品进行转录组分析。通过对原始测序数据进行质量控制,并利用 HISAT 软件等对处理后数据拼接到亚麻参考基因组,获得了高质量 Unigenes 和拼接结果。对 Unigenes 进行序列比对、功能注释和分类、序列变异分析。结果显示,本次测序结果共获得 43 471 Unigene,并且这些 Unigenes 的大部分(89.6%)都完全比对到参考基因组的预测外显子区域。对测序结果的 KOG KEGG 分析结果表明亚麻在铅胁迫条件下可能影响的通路信息。最后,对测序结果进行转录因子预测和序列变异分析,为后续针对亚麻响应重金属胁迫的相关研究提供了候选分子资源。
 

关键词
亚麻(Linum usitatissimum);铅胁迫;转录组;序列变异;转录因子

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《分子植物育种》印刷版
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