研究报告

水杉泛素结合酶基因的克隆  

杨海鹏1 , 徐劲松1 , 张红梅1 , 惠国强1 , 刘小红3* , 赵丽芳1 , 孙毅2
1 山西省农业科学院玉米研究所, 忻州, 034000; 2 山西省农业科学院玉米生物技术研究中心, 忻州, 030031; 3 西华师范大学生命科学学院, 西南野生动植物资源保护教育部重点实验室, 南充, 637002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2019年03月29日    接受日期: 2019年04月30日    发表日期: 2020年06月24日
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摘要

水杉(Metasequoia glyptostroboides)是著名的杉科孑遗植物,对水杉的分子遗传研究在其资源保护和利用方面具有重要意义。本研究以水杉为实验材料,在全长转录组测序的基础上克隆了一个泛素结合酶基因(MgUC-E2),并进一步对该基因作了生物信息学分析。结果表明:MgUC-E2 基因 cDNA 编码链全长为 691 nt,可以编码长度为 148 个氨基酸的泛素结合酶。该酶蛋白的分子量为 16 545.09 kD,等电点为 7.72,平均吸水值为 -0.343;含有 15 个磷酸化修饰位点和 5 个常见功能位点;在预测的二级结构中共包括 5 个螺旋区、4 个折叠区和一些无规则卷曲区;三级结构分析的结果进一步证实 MgUC-E2 基因就是编码泛素结合酶。本研究结果可为水杉及其它相关物种的泛素结合酶基因的结构及功能研究提供一些参考。

关键词
水杉(Metasequoia glyptostroboides);泛素结合酶;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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