甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃省干旱生境作物学重点实验室,兰州, 730070
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 3 篇
收稿日期: 2019年03月26日 接受日期: 2019年04月02日 发表日期: 2020年05月26日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 3 篇
收稿日期: 2019年03月26日 接受日期: 2019年04月02日 发表日期: 2020年05月26日
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摘要
磷酸蔗糖磷酸化酶(sucrose phosphate phosphatase, SPP)是蔗糖合成最后步骤的关键酶,在参与小麦(Triticum aestivum)蔗糖代谢转运和籽粒灌浆中起重要作用。为了在基因组 DNA水平上揭示小麦 SPP酶基因的结构特征,预测该基因所编码蛋白特性,本研究通过克隆小麦 SPP 酶全长基因,利用生物信息学方法,从基因结构、理化特性、进化关系、亚细胞定位、跨膜结构和二级结构等方面对该基因进行了预测和分析。结果表明:通过克隆、测序和拼接,获得小麦磷酸蔗糖磷酸化酶基因(TaSPP2),该基因全长 2 865 bp,包含 8个外显子区和 7个内含子区,被定位在小麦 D 基因组上。TaSPP2 与粗山羊草(Aegilops tauschii)亲缘关系最近。该基因编码的蛋白分子量为 47.19 kD,等电点为 6.04,含有 38 处磷酸化位点,不含跨膜区,属于非分泌型亲水胞内蛋白。二级结构以无规则卷曲为主(45.02%),其次是α- 螺旋占和延长链,无β- 转角。本研究结果将为进一步验证和解析小麦 TaSPP2 基因的功能提供理论依据。
关键词
小麦(Triticum aestivum);TaSPP2;基因克隆;生物信息学分析
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