研究报告

水稻 microRNA1876 功能验证与生物信息学分析  

蔡俊 , 陈信波 *
湖南农业大学, 作物基因工程湖南省重点实验室, 长沙, 410128
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2019年03月09日    接受日期: 2019年03月15日    发表日期: 2020年05月25日
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摘要

MicroRNA (miRNA)是一类由内源基因组转录的有基因调控功能的非编码短序列 RNA,在动植物中参与转录后基因表达调控。为了研究 Osa-miRNA1876 基因功能,本研究对 Osa-miRNA1876 进行生物信息学分析,分析出启动子区间有与逆境相关的主要顺式作用元件 AREGC-motifGT1-motifSp1 LTR,并预测到了靶基因 Os02t0476700-01。通过茎环法 qRT-PCR,以水稻 U6 基因为内参基因,对 Osa-miRNA1876 在水稻分蘖期进行了相对定量。在水稻基因组中,克隆得到 Osa-miRNA1876 的前体基因,并根据 Osa-miRNA1876序列设计了短串联靶标模拟物(short tandem target mimic, STTM)功能片段;将二者整合到植物表达载体 pCAMIBA1390,分别获得了过表达载体 pOsa-miRNA1876-OE 和干扰载体 pOsa-miRNA1876-STTM。用于后续的 Osa-miRNA1876 基因功能研究。
 

关键词
MicroRNA1876;生物信息学;qRT-PCR;短串联靶标模拟物

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《分子植物育种》印刷版
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