研究报告

基于转录组测序的苦瓜热激蛋白相关基因分析  

杜文丽1 , 陈中钐1 , 许端祥1 , 徐同伟1 , 高山 1* , 温庆放2*
1 福州市蔬菜科学研究所, 福州, 350111; 2 福建省农业科学院作物研究所, 福州, 350013
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2019年03月07日    接受日期: 2019年03月14日    发表日期: 2020年05月28日
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摘要

为获得苦瓜叶片高温胁迫状态下表达的相关基因,本研究以高温胁迫下苦瓜叶片为实验材料,采用 Illumina HiSeq 2500 高通量测序技术对正常温度(26)和高温胁迫(38)下苦瓜叶片转录测序后进行组装,再利用 KEGGPfamSwiss-Prot NR 数据库平台对热激蛋白的相关功能基因筛选,共获得 24 个热激蛋白相关基因,包括得 20 个热激蛋白基因、2 个位于叶绿体中的小热激蛋白以及 2 个热激转录因子。聚类分析研究表明,涉及到热激蛋白相关的 20 Unigene 广泛分布于 3 大类中,其中 c42567 c43094 这两个亲缘关系最近;两个小热激蛋白 c42963 c12133 的亲缘关系次之;c35683 c3040 两个热激转录因子亲缘关系最远。通过本次研究中获取的 24 个热激蛋白相关 Unigene 信息,有助于深入研究苦瓜耐高温胁迫机理等提供数据信息。
 

关键词
苦瓜(Momordica charantia L.);转录组测序;功能注释;热激蛋白相关基因

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《分子植物育种》印刷版
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