赵彤 , 常圣鑫 , 冷青云 , 徐世松 , 尹俊梅 , 牛俊海

1 海南大学热带农林学院, 海口, 571100; 2 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室,海南省热带观赏植物种质创新利用工程技术研究中心,儋州, 571737
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《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 24 篇   
收稿日期: 2019年03月06日    接受日期: 2019年04月08日    发表日期: 2019年08月05日

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为了明确三角梅转录组 SSR 总体特征、开发出适用于分子育种的 SSR 引物，本研究对三角梅 ‘小叶紫’叶、苞片、花等组织进行了转录组测序，采用 MISA分析‘小叶紫’转录组 SSR 位点信息，利用 Primer 3设计引物，并选择 50对引物对 6个不同种或杂交种三角梅进行可转移性与多样性分析。结果表明：在‘小叶紫’转录组中，共检测出 79 210个SSR位点，分布于 60 318条 Unigene中，出现频率为44.91%。优势重复基序为单核苷酸、双核苷酸，分别占总 SSR 位点的 76.37%和 13.26%。A/T和 AG/CT分别是单核苷酸、双核苷酸的优势重复基元，占总SSR重复类型的71.66%和6.77%。挑选的50对引物中，有 42对引物可以扩增到清晰稳定的目标条带，有效扩增率为 84.00%，不同品种间的平均可转移率为 85.86%；其中 33对引物具有多态性，平均 He和 PIC分别为 0.554 8 和 0.460 3。以上结果表明，基于三角梅转录组序列的 SSR标记开发是可行有效的，开发的引物将有助于开展种质资源评价和遗传多样性分析。

三角梅(Bougainvillea)；SSR；转录组；分子标记