研究报告

欧李 ChCBF1 基因的克隆及生物信息学分析  

汪泽文1 , 穆霄鹏1 , 王鹏飞1 , 张建成1 , 杨依维1 , 付鸿博 1,2 , 杜俊杰1
1 山西农业大学园艺学院, 太谷, 030801; 2 黑龙江省农业科学院乡村振兴科技研究所, 哈尔滨, 150000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2019年03月05日    接受日期: 2019年04月11日    发表日期: 2020年04月30日
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摘要

本试验在欧李基因组研究的基础上,利用 RT-PCR 方法从低温处理的‘农大 4 号’欧李叶片中克隆到了 ChCBF1 基因,该基因 CDS 序列长度为 690 bp,编码 229 个氨基酸的蛋白,分子量为 25.10 kD,等电点为 4.94,蛋白不稳定指数为 58.72。二级结构主要由 - 螺旋,延伸链,- 折叠和无规则卷曲构成。启动子分析表明,ChCBF1 基因的启动子元件包括低温响应元件、多个光响应相关元件以及激素响应元件等一系列诱导型顺式调控元件。通过氨基酸同源比对和系统发育树分析发现,ChCBF1 基因编码的氨基酸序列与桃的相似性最高,达到 95%。本研究为后续逆境与休眠诱导相关方面的基因功能验证提供了帮助。

关键词
欧李;转录因子 CBF1;生物信息分析

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《分子植物育种》印刷版
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