中国林业科学研究院热带林业研究所, 热带林业研究国家林草局重点实验室, 广州, 510520
作者
通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 27 篇
收稿日期: 2019年03月04日 接受日期: 2019年03月11日 发表日期: 2020年05月26日
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 27 篇
收稿日期: 2019年03月04日 接受日期: 2019年03月11日 发表日期: 2020年05月26日
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摘要
油楠(Sindora glabra)作为极具开发潜力的能源植物,在分子水平上的研究仅局限于 ISSR 分子标记。本研究利用 Trinity 软件对油楠转录组数据进行组装,共得到总长为 48 307 806 bp 的 283 998 条 Unigenes。利用 MISA 软件寻找到 97 443 个含有 SSR 的重复基元。SSR 位点中主要重复序列为单核苷酸和二核苷酸,分别占总 SSR 位点的 67.68% 和 22.56%,其次是三核苷酸,占 8.54%。利用 Primer 3.0 设计引物,并从中随机选择 200 对引物进行 PCR 扩增,其中有 13 对扩增出清晰条带,多态性高,重复性好。油楠 SSR分子标记的开发对于研究其遗传多样性、重要性状基因定位及分子标记辅助选择育种等起到重要的推动作用。
关键词
油楠(Sindora glabra);转录组;SSR;分子标记
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