研究报告

正交设计优化番石榴属(Psidium)植物 SSR-PCR 反应体系和引物筛选  

马泽华 1 , 刘顺枝 1 , 徐社金 2 , 汪永红 1 , 胡位荣 1*
1 广州大学生命科学学院, 广州, 510006; 2 广州市果树科学研究所, 广州, 510405
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2019年02月21日    接受日期: 2019年02月28日    发表日期: 2020年06月17日
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摘要
4 份番石榴属植物嫩叶为材料,利用 L16 (43)正交试验设计方法,对 2×Taq Mix、模板DNA、引物浓度 3 个因素进行 4 个水平筛选。结果表明,反应各因素对 SSR-PCR 体系的影响程度为2×Taq Mix用量>DNA 模板量>引物浓度,适合番石榴属植物SSR-PCR 反应的最佳体系为 20 μm/L。反应体系包含了DNA模板40 ng、引物各0.3滋mol/L、2伊Taq Mix 10 μm/L,ddH2O 4.8 μm/L;运用该优化体系从23 对 SSR 引物中筛选出21对扩增条带清晰、多态性良好的SSR 引物,多态引物占比91.30%;利用 9 份番石榴种质验证了SSR-PCR 体系具有较高的稳定性和重复性。
关键词
番石榴属;正交设计;SSR-PCR 体系优化;引物筛选

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《分子植物育种》印刷版
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