研究报告
杜仲雌花芽 2 个发育时期转录组分析 
朱利利 
,
庆军 ,
何凤 ,
杜庆鑫 ,
杜红岩 * 
,
庆军 ,
何凤 ,
杜庆鑫 ,
杜红岩 *
中国林业科学研究院经济林研究开发中心, 国家林业和草原局杜仲工程技术研究中心, 郑州, 450003
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 12 篇
收稿日期: 2019年02月20日 接受日期: 2019年02月27日 发表日期: 2020年06月12日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 12 篇
收稿日期: 2019年02月20日 接受日期: 2019年02月27日 发表日期: 2020年06月12日
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摘要
杜仲(Eucommia ulmoides)的果实是提取杜仲胶和杜仲籽油的重要原材料，在工业、医疗、食品等领域开发前景广阔。为了揭示雌蕊原基发育相关基因的表达情况，本研究以杜仲果用良种‘华仲 6 号’(Huazhong No.6)为材料，利用 lllumina Hiseq X-10 高通量测序平台，分别对花序原基分化期和雌蕊原基分化期的花芽进行转录组测序，通过生物信息学对 2 个发育时期的雌花芽转录组进行比较分析，筛选出与杜仲雌蕊原基发育相关的差异基因。结果显示，转录组测序共获得 68.11 Gb 数据，各样品的 Clean reads 与杜仲基因组进行序列比对，比对效率为 91.59%~92.05%，同时 2 个发育时期共筛选出 485 个差异表达基因，其中 219个差异基因在雌蕊原基分化期表达上调，266 个表达下调。差异基因 GO 富集结果表明，花的发育、光周期现象、激素生物合成以及蛋白结合转录因子活性等相关的生物途径被富集。KEGG 富集结果表明淀粉和蔗糖代谢、碳代谢、昼夜节律和植物激素信号转导等代谢通路被富集。结果表明光周期途径是诱导杜仲成花的重要途径，且雌蕊原基发育受碳水化合物、植物激素和其他代谢物质调控。本研究为杜仲花器官发育调控基因的挖掘提供了基础数据，也为果用杜仲的分子育种提供了参考。
关键词
杜仲； 雌花芽；2 个发育时期；转录组分析
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