北京林业大学生物科学与技术学院, 计算生物学中心, 北京, 100083
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 24 篇
收稿日期: 2019年02月18日 接受日期: 2019年02月28日 发表日期: 2019年12月14日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 24 篇
收稿日期: 2019年02月18日 接受日期: 2019年02月28日 发表日期: 2019年12月14日
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摘要
幼苗建成是植物生活史中的重要组成阶段,幼苗生长为植物后续发育、抗性、产量提升等提供帮助。一般幼苗生长的研究多数集中于基因功能解析及各基因引起的表型变异,缺乏全基因组水平的系统性机制解析。为揭示幼苗生长的遗传机制,本研究以胡杨为试验材料,从中国西北胡杨自然分布区采集亲本,杂交获得 F1 子代群体,并对群体进行全基因组水平的分子标记测定。通过 F1 代群体在透明培养基的种子萌发实验,获得共计 408 个基因型单株的幼苗生长性状,包括不同时间点的茎高与根长表型。对不同时间点的生长数据构建动态表型向量,利用功能定位模型对茎高与根长进行 QTL 定位分析。模型利用生长曲线整合至统计框架的优势,对茎高定位出 94 个 SNP 位点,各分布于连锁群 1、6、7、9、10、13、15、16、17、18、19;对主根长定位出 130 个显著 SNP 位点,其中 31 个位于蛋白编码基因区域。功能注释揭示了 ABA 信号与生长素响应通路的相关基因分别参与调控幼苗茎高与主根生长,泛素 -26S 介导的蛋白降解途径可同时参与茎高与主根长性状的遗传调控。功能定位为幼苗生长遗传结构的描绘提供了丰富结果,也将对重要沙漠树种的生长、胁迫防御等问题的研究起促进作用。
关键词
胡杨(Populus euphratica);QTL; 幼苗; 生长;功能作图
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