贺润丽¹ , 尹桂芳² , 李春花² , 王莉花^2* , 马颖榆¹ , 王梦莹¹ , 阎仕豪¹

1 山西中医药大学中药与食品工程学院, 太原, 030619; 2 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所, 云南省农业生物技术重点实验室, 农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室, 昆明, 650223
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 27 篇   
收稿日期: 2019年02月12日    接受日期: 2019年02月18日    发表日期: 2020年09月14日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

为开发苦荞新的 SSR 标记，本研究利用 MISA 软件对苦荞种皮转录组测序数据进行 SSR 位点信息搜索，利用 Primer 3 设计引物并随机选择 53 对引物进行验证。结果表明：苦荞种皮转录组数据库中共搜索到9 094 个 SSR 位点，其中，单核苷酸、三核苷酸和二核苷酸重复类型占优势，占总 SSR 的 63.99%、19.35%、15.49%；共发现 70 种重复基元，其中 A/T、AT/AT、AAG/CTT 基元是优势基元。设计合成的 53 对引物中，41对引物(77.36%)获得有效扩增，21 对引物具有多态性。本研究从转录组序列中大规模开发的 SSR 分子标记将有助于苦荞遗传多样性与分子育种研究。 

苦荞； 转录组； 测序； SSR