研究报告
蓖麻 AP2/ERF 转录因子家族的生物信息学分析 
闫星伊 1,2 
,
风兰 2 ,
韩雯毓1,2 ,
李国瑞 2 ,
黄凤兰 2 ,
陈永胜 2*
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风兰 2 ,
韩雯毓1,2 ,
李国瑞 2 ,
黄凤兰 2 ,
陈永胜 2*
1 内蒙古民族大学农学院, 通辽, 028000; 2 内蒙古民族大学, 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心, 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验
室, 内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心, 通辽, 028000
作者 
通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2019年01月31日 接受日期: 2019年02月08日 发表日期: 2020年05月24日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2019年01月31日 接受日期: 2019年02月08日 发表日期: 2020年05月24日
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摘要
AP2/ERF 家族是一种广泛存在于植物体内的重要转录因子，该转录因子大多数参与植物的生长发育、生理代谢以及抵抗非生物胁迫的过程。本研究利用蓖麻基因组数据库寻找到了 113 个蓖麻 AP2/ERF 家族基因，利用生物信息学方法对这 113 个蛋白序列构建无根进化树，且对氨基酸组成成分进行分析，发现组成蛋白质的氨基酸数目在不同亚族之间差异较大，其中 AP2 亚族的平均氨基酸数目为个 439，亚族中最小的平均氨基酸数目为 ERF 亚族，平均为 255 个。在蓖麻的 113 个蛋白序列中大部分为稳定的亲水性蛋白、且含有多个磷酸化位点、在该蛋白中 琢－螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构方式，除AP2 亚族外，其余亚族均含有 茁－转角，亚族无规则卷曲均占50%以上，说明延伸链和 茁－转角则分散在整个氨基酸链中。三级结构
与二级结构预测一致。还对保守结构域、蛋白无序化特性等进行了预测和较为全面的分析。这些分析结果为进一步研究蓖麻中 AP2/ERF 转录因子对生长发育过程中的作用提供了理论依据。
关键词
蓖麻(Ricinus communis)；AP2/ERF 转录因子；生物信息学；进化树
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