研究报告
水稻杂种劣势相关亲本的全基因组重测序及其遗传变异分析 
李伟1* 
,
周丽 1* ,
朱骞 1,2 ,
Sadia Nadir 3,4 ,
郭效琼 1 ,
李梦婷 1 ,
文建成1 ,
陈丽娟1,2** 
,
李东宣 1,2**
,
周丽 1* ,
朱骞 1,2 ,
Sadia Nadir 3,4 ,
郭效琼 1 ,
李梦婷 1 ,
文建成1 ,
陈丽娟1,2** ,
李东宣 1,2**
1 云南农业大学, 稻作研究所, 昆明, 650201; 2 云南农业大学, 省部共建云南生物资源保护与利用国家重点实验室, 昆明, 650201; 3 本努科技大学,本努, 28100, 巴基斯坦; 4 中国科学院昆明植物研究所山地生态系统研究中心, 昆明, 650201
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 1 篇
收稿日期: 2019年01月27日 接受日期: 2019年02月11日 发表日期: 2020年05月18日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 1 篇
收稿日期: 2019年01月27日 接受日期: 2019年02月11日 发表日期: 2020年05月18日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要
杂种劣势是在产量、生物量以及其它一些农艺性状表现与杂种优势相反的一种现象，而在杂种劣势的相关分子机理研究方面很少受到关注。为了解析杂种劣势的相关分子机理，本研究旨在利用杂种劣势相关的 3 个粳稻品种‘Aranghyangchalbyeo’(CH7)、‘Sanghaehyangheolua’(CH8)和‘Shinseonchalbyeo’(CH9)进行全基因组重测序，分析全基因组序列变异，解析杂种劣势的遗传基础。通过与粳稻品种‘日本晴’参考基因组的比对分析，在 CH7、CH8 和 CH9 基因组中分别获得了 574 551 个、1 026 428 个和 792 465 个变异位点，包括 SNPs 和 InDels 变异位点。同时，基于基因组的拷贝数变异(CNVs)检测，在 CH7、CH8 和 CH9 基因组中分别获得了 5 698 个、6 872 个和 6 133 个拷贝数变异位点。此外，本研究也发现 CH7、CH8 和 CH9 基因组的变异位点在水稻的 12 条染色体上的分布是不均匀的。这些结果明确了相关基因组中的变异位点信息，为进一步研究杂种劣势的遗传机理提供了基础。
关键词
水稻(Oryza sativa L.)；杂种劣势；全基因组重测序； 遗传变异
HTML格式版本正在制作中。
