研究报告

中间锦鸡儿WRKY12基因克隆与生物信息学分析  

万东莉1,2 , 张杰2 , 王瑞刚1 , 李国婧1 , 万永青1*
1 内蒙古农业大学生命科学学院, 内蒙古自治区植物逆境生理与分子生物学重点实验室, 呼和浩特, 010018; 2 中国农业科学院草原研究所, 农业部草地生态与修复治理重点实验室, 呼和浩特, 010010
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2018年12月26日    接受日期: 2019年01月10日    发表日期: 2020年02月17日
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摘要

WRKY 转录因子是植物信号网络中不可缺少的部分,是最大的调节子家族之一。本研究从中间锦鸡儿干旱转录组及基因表达检测数据中,挑选出对干旱、冷、盐、碱及 ABA 都响应明显的 CiWRKY12 基因,对其进行克隆及生物信息学分析。结果显示:CiWRKY12 基因的开放阅读框为 696 bp,编码 232 个氨基酸,含有一个典型的 WRKY 保守结构域,属于 roup c 亚族。对转录因子 CiWRKY12 与其它 8 种植物的同源蛋白的理化性质和一、二、三级结构进行生物信息学比较分析,发现这 9 个蛋白无规则卷曲比例较高,大部分属于不稳定蛋白;亚细胞定位预测表明大部分的蛋白定位于细胞核内;多重序列比对显示 WRKY 保守结构域保守性很高,其三级结构上也呈现较高的相似性,推测这 9 个转录因子可能具有相似的转录调控功能。通过本研究生物信息学分析将有助于对 CiWRKY12 深层次功能研究提供借鉴作用。

关键词
中间锦鸡儿(Caragana intermedia); WRKY12; 基因克隆;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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