研究报告

菜心BcFLC1的SNP变异与选择性剪接  

陶鹏 , 赵彦婷 , 钟新民 , 岳智臣 , 雷娟利 , 李必元*
浙江省农业科学院蔬菜研究所, 杭州, 310021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 20 篇   
收稿日期: 2018年12月11日    接受日期: 2018年12月14日    发表日期: 2020年12月14日
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摘要

为探讨菜心极易抽薹开花的分子机制,本研究以早熟类型的‘四九菜心’为研究材料,参考大白菜基因组分析了菜心开花抑制基因 BcFLC1 的转录组 SNP 情况,鉴定了 3 个纯合 SNP 位点。其中一个 SNP 定位在 6 号内含子(I6)的剪接供体位点“GT”上,在菜心中突变为“AT”。研究发现菜心 BcFLC1 剪接位点变异导致其在 pre-mRNA 加工中发生了选择性剪接,产生了 6 种剪接异构体,并分析了每种剪接方式的频率。预测了菜心 6 BcFLC1 剪接异构体的蛋白产物,显示这些蛋白产物均异常,缺失 6 号或 7 号外显子以及氨基酸片段的插入。最后比较了大白菜、结球甘蓝以及菜心中 FLC1 SNP 变异与选择性剪接。本研究分析了菜心BcFLC1 SNP 变异及其诱导的选择性剪接的特征,为阐释了菜心极易抽薹开花的分子机制提供了理论依据。
 

关键词
菜心(Brassica papachinensis); BcFLC1;SNP 变异; 选择性剪接

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《分子植物育种》印刷版
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