郭丹丹 , 袁凤杰 , 郁晓敏^*

浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所, 杭州, 310021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2018年12月10日    接受日期: 2019年01月22日    发表日期: 2020年03月17日

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为揭示籽粒型和鲜食型大豆基因组间的差异，本研究对 2 个籽粒大豆品种‘浙春 3 号’、 ‘浙春 4 号’和 2 个鲜食大豆品种‘浙鲜豆 8 号’、 ‘浙鲜 9 号’进行全基因组重测序，平均测序深度为 6X，覆盖度大于 94%。通过与参考基因组比对发现，籽粒大豆平均杂合率 12.24%，鲜食大豆平均杂合率 10.97%，籽粒型大豆杂合度高于鲜食型。2 个籽粒型大豆插入和缺失变异占总变异 21.89%，染色体间易位变异占总变异 41.04%；而2 个鲜食型大豆缺失变异占总变异 22.38%，染色体间易位变异占总变异 46.15%，籽粒型大豆缺失变异率和染色体间易位变异率均低于鲜食型大豆。研究结果在一定程度上反映了籽粒型大豆和鲜食型大豆在基因组水平的差异，为分子标记辅助选择育种提供了科学依据。

全基因组重测序；籽粒大豆；鲜食大豆；单核苷酸多态性；结构变异