研究报告

南方型紫花苜蓿(Medicago sativa 'Millenium')耐盐相关 miRNAs及靶基因预测  

王依纯 , 李佳赟 , 马进*
浙江农林大学风景园林与建筑学院,临安, 311300
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2018年12月10日    接受日期: 2018年12月17日    发表日期: 2020年06月17日
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摘要

为了解盐胁迫下南方型紫花苜蓿(Medicago sativa 'Millenium')的内在分子机制,挖掘其与耐盐相关的 miRNA及相关靶基因。以 250 mmol/L NaCl溶液处理 72 h后的南方型紫花苜蓿耐盐突变体根部为材料进行 Illumina HiSeqTM2000高通量测序,构建 6个南方型紫花苜蓿突变体根部盐胁迫前后 sRNA文库,共获得分属于 79个家族的 447个已知 miRNA146个新 miRNA,并在已知 miRNAs中筛选出盐胁迫差异表达 miRNA46(12个上调, 34个下调),新 miRNA中筛选出差异表达 miRNA19(7个上调, 12个下调)。利用 psRNATargetTargetFinderTapirhybrid软件对所获得的差异表达 miRNA进行靶基因预测,预测得到1 190个靶基因,基因本体(Gene ontology)功能分析揭示了这些靶基因的两个主要功能类别,即分子功能与生物过程。为验证高通量测序数据的可效性,筛选 6miRNA及其靶基因进行 qRT-PCR验证,实验表明这些 miRNA均被检测发现且大部表达结果与测序结果一致。此外,还鉴定出部分差异表达 miRNA的靶基因,这些基因参与植物生长、发育及盐胁迫反应。本研究表明,盐胁迫下,南方型紫花苜蓿耐盐突变体通过体内miRNA调控一系列转录因子的方式提高植株耐性,减少盐胁迫对植株的伤害。
 

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《分子植物育种》印刷版
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