研究报告

豇豆(Vigna unguiculata) VQ 蛋白家族基因的序列与进化分析  

lizong
1 周口师范学院生命科学与农学学院, 周口, 466001; 2 周口师范学院, 河南省作物分子育种与生物反应器重点实验室, 周口, 466001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2018年11月28日    接受日期: 2018年12月05日    发表日期: 2020年05月22日
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摘要

VQ 蛋白是一类植物特有的转录调控辅助因子,主要与 WRKY 蛋白互作,参与诸多生物学功能。尽管一些植物 VQ 家族基因已经被鉴定,但在豇豆中有关 VQ 家族基因的研究未见报道。本研究利用生物信息学手段从豇豆中鉴定出 37 VuVQ 基因,并详细分析这些基因的序列、微共线性、表达谱与进化关系。染色体与共线性分析表明,豇豆 VuVQ 基因定位在 11 条染色体上,基因扩增主要由片段重复产生,其中 4 对重复基因所在区段共线性程度高。序列分析结果显示:豇豆 VuVQ 基因结构有 3 种类型,绝大多数无内含子;豇豆 VQ 蛋白均包含 VQ 结构域,同时这些 VQ 保守基序数目和顺序变异较高。进化研究揭示豇豆 VQ 蛋白存在 6 大类群,这些类群均起源于陆生植物。选择压力检测表示,豇豆的 8 VuVQ 基因均受严格的负选择。表达分析表明了豇豆 VQ 基因具有多样化的表达模式,这意味着 VQ 蛋白参与多种生物学过程。本研究结果为豇豆 VQ 基因的功能解析提供线索。
 

关键词
豇豆(Vigna unguiculata);VQ 家族;基因;结构域;进化

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《分子植物育种》印刷版
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