陕西国际商贸学院, 陕西省中药绿色制造技术协同创新中心, 咸阳, 712046
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 12 篇
收稿日期: 2018年11月22日 接受日期: 2018年12月21日 发表日期: 2020年04月30日
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 12 篇
收稿日期: 2018年11月22日 接受日期: 2018年12月21日 发表日期: 2020年04月30日
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摘要
为了获得罗布麻转录组信息,研究罗布麻中功能基因的表达以及分子标记的开发,本研究采用Illumina HiSeq2000 高通量测序技术对罗布麻进行转录组测序及分析。通过过滤掉低质量的读序,共获得26 148 138 个高质量的读序,组装得到 61 538 个 Unigene 序列。其中,有 25 296 个 Unigene 在公共数据库中得到注释。通过 KEGG 分析,共发现 29 个 Unigene 参与活性成分(黄酮类)生物合成。检测出单核苷酸至六核苷酸重复类型的 SSR 位点 13 524 个。本研究结果分析了参与黄酮类化合物合成的相关基因以及潜在的SSR 位点,为进一步研究罗布麻次生代谢产物合成的功能基因的挖掘、分子标记的开发以及资源利用提供有用的信息。
关键词
罗布麻(A pocynum venetum);转录组;黄酮类化合物;SSR
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