研究报告

NaCl胁迫下柳树的转录组测序与初步分析  

李佳迪1 , 李子英2 , 丛日春 1*
1中国林业科学研究院荒漠化研究所,北京, 100091; 2国际泥沙研究培训中心,北京, 100044
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2018年11月20日    接受日期: 2018年11月27日    发表日期: 2020年05月27日
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摘要

从组学水平分析盐胁迫下柳树内在分子机制,为柳树耐盐研究及耐盐基因的挖掘利用提供理论依据。本研究通过转录组测序技术对‘盐柳 1号’(Salix psammophila 'Yanliu No.1')和‘渤海柳 1号’(Salix matsudana 'Bohailiu No.1')150 mmol/L NaCl 胁迫处理后的叶片和正常叶片(对照)进行高通量转录组测序,并对获得的 unigene 进行从头组装和注释分析。结果表明:转录组测序共获得 183 987 Unigenes,平均长度为1 080.18 bp,分别有 120 130 条、140 813 条、98 066 条、88 425 条、47 982条、83 732 Unigenes 被注释到 NTNRCOGSwissProtKEGGCOGGO 数据库,共有 149 864 (81.45%) Unigenes 得到注释。在 GO 功能注释中,共得到 55GO 功能小类,在 KEGG 代谢通路分析时,获得了 135 KEGG 通路。该转录组测序数据质量高,结果覆盖面广,为柳树耐盐基因挖掘和研究提供了一定的理论参考。
 

关键词
‘盐柳 1号’‘渤海柳 ; 1号’,盐胁迫;高通量测序;转录组分析

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《分子植物育种》印刷版
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