1中国林业科学研究院荒漠化研究所,北京, 100091; 2国际泥沙研究培训中心,北京, 100044
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2018年11月20日 接受日期: 2018年11月27日 发表日期: 2020年05月27日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2018年11月20日 接受日期: 2018年11月27日 发表日期: 2020年05月27日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要
从组学水平分析盐胁迫下柳树内在分子机制,为柳树耐盐研究及耐盐基因的挖掘利用提供理论依据。本研究通过转录组测序技术对‘盐柳 1号’(Salix psammophila 'Yanliu No.1')和‘渤海柳 1号’(Salix matsudana 'Bohailiu No.1')经 150 mmol/L NaCl 胁迫处理后的叶片和正常叶片(对照)进行高通量转录组测序,并对获得的 unigene 进行从头组装和注释分析。结果表明:转录组测序共获得 183 987 条 Unigenes,平均长度为1 080.18 bp,分别有 120 130 条、140 813 条、98 066 条、88 425 条、47 982条、83 732 条 Unigenes 被注释到 NT、NR、COG、SwissProt、KEGG、COG和 GO 数据库,共有 149 864 条(81.45%) Unigenes 得到注释。在 GO 功能注释中,共得到 55个 GO 功能小类,在 KEGG 代谢通路分析时,获得了 135 条 KEGG 通路。该转录组测序数据质量高,结果覆盖面广,为柳树耐盐基因挖掘和研究提供了一定的理论参考。
关键词
‘盐柳 1号’‘渤海柳 ; 1号’,盐胁迫;高通量测序;转录组分析
HTML格式版本正在制作中。