曾靖雯 , 马文涛 , 鲁敏 , 安华明^*

贵州大学农学院, 贵州省果树工程技术研究中心, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2018年10月31日    接受日期: 2018年11月30日    发表日期: 2020年03月17日

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TRANSPARENT TESTA GLABRA1 (TTG1)基因编码具有 WD40 重复序列蛋白，对植物的毛状体形成发育起重要作用。本试验以‘贵农 5 号’刺梨为材料，基于果实转录组测序，采用 RT-PCR 的方法获得刺梨TTG1 基因的 cDNA 序列(命名为 RroTTG1)，并进行相关生物信息学预测分析。结果显示，RroTTG1 基因的开放阅读框序列长度为 1 041 bp，编码 345 个氨基酸。预测得到该蛋白含有典型的 WD40-repeat 保守结构域，具有较好的亲水性，但不是膜蛋白或分泌蛋白；含有 45 个磷酸化位点；二级结构有 11.27% 琢- 螺旋、33.53%茁- 折叠、4.43% 茁- 转角和 50.87%无规卷曲；蛋白系统进化树分析表明该蛋白与蔷薇科的玫瑰、月季、草莓和覆盆子等的同源基因聚在一起，尤其与玫瑰(Rosa rugosa) TTG1 亲缘关系最近。本研究为进一步探索RroTTG1 基因在刺梨毛状体起始和发育中的功能提供了科学依据。

刺梨(Rosa roxbunghii)；RroTTG1；克隆；生物信息学分析