研究报告

广藿香法呢基焦磷酸合成酶基因(FPS)的克隆及生物信息学分析  

张贵翔 , 吴友根 , 陈赫 , 于靖 , 杨东梅 , 张军锋 , 杨豫章
海南大学热带农林学院, 海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2018年10月29日    接受日期: 2018年12月04日    发表日期: 2019年05月09日
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摘要

为进一步阐明广藿香(Pogostemon cablin (Blanco) Benth.)中百秋李醇(Patchouli alcohol)生物合成的分子调控机制,本研究采用 RT-PCR 技术从广藿香叶片中克隆得到法呢基焦磷酸合成酶(farnesyl diphosphate synthase) FPS 基因,并通过 qRT-PCR 技术分析 FPS 基因在广藿香幼苗期(扦插后 60 d)与成熟期(扦插后 240 d)叶片中的相对表达量。对克隆得到的广藿香 FPS 基因进行生物信息学分析,序列片段长为 1 177 bp,其中包含 1 个长度为 1 050 bp 的开放阅读框,编码由 349 个氨基酸残基构成的蛋白质,与其它已知 FPS 氨基酸序列的唇形科植物一致性高达 93.10%,与已知的米团花(Leucosceptrum canum Smith) FPS 蛋白亲缘关系最近。预测 FPS 蛋白质分子质量约为 40.09 kD,理论等电点(pI)5.34,推测其为亲水性蛋白,无跨膜区且不含信号肽,属于类异戊二烯生物合成家族。qRT-PCR 结果表明 FPS 基因在成熟期叶片中表达量高于幼苗期,与转录组数据分析结果一致。本研究结果为进一步研究 FPS 基因在广藿香中的应用,探究广藿香中百秋李醇生物合成途径中关键酶的表达模式及通过调控百秋李醇生物合成提高广藿香挥发油中有效成分含量提供了理论依据。

关键词
广藿香;法呢基焦磷酸合成酶;百秋李醇;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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