研究报告

河北省小麦品种基于SNP标记的遗传多样性分析  

李珊珊1 , 易腾飞1 , 徐渴1 , 张树华2 , 赵勇1* , 杨学举2*
1 河北农业大学农学院, 河北省作物种质资源实验室, 保定, 071000; 2 河北农业大学生命科学学院, 保定, 071000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 37 篇   
收稿日期: 2018年10月23日    接受日期: 2018年10月31日    发表日期: 2020年02月16日
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摘要

为明确河北省小麦品种的遗传多样性,以 143 份小麦品种为材料,利用小麦 90K 基因芯片分型数据,分析其亲缘关系与遗传多样性。结果表明:质量控制后具有多态性的 SNP (24 758 )占基因分型后 SNP(81 587 )30.34%,多态性 SNP 标记在染色体组分布不均,其中 B 基因组最多,D 基因组最少,平均遗传距离为 0.17 cM。群体结构分析将 143 份小麦材料分为 3 个亚群,且 3 个亚群间基因交流密切。143 份小麦品种两两间的遗传相似系数变幅为 0.437 6~0.996 8,平均值为 0.601 8,主要分布于 0.52~0.73 之间,占 89.23%(8 932/10 010)。根据遗传相似系数,以 K- 均值聚类方法将 143 份小麦品种(品系)分为 5 个亚群。本研究揭示了河北省小麦品种的亲缘关系与遗传多样性,为育种家杂交亲本选配提供了依据。

关键词
小麦;遗传多样性;遗传相似系数; 单核苷酸多态性(SNP)

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《分子植物育种》印刷版
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