研究报告

蓖麻 PDCT 基因启动子的克隆及生物信息学分析  

狄建军1,3,4* , 孙佳欣1* , 朱海芳1 , 王月2 , 黄凤兰1,3 , 陈永胜1,3
1 内蒙古民族大学生命科学学院, 通辽, 028043; 2 内蒙古民族大学农学院, 通辽, 028043; 3 内蒙古民族大学, 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心, 内蒙古自治区蓖麻产业协同创新中心, 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室, 通辽, 028043; 4 内蒙古民族大学生物信息学重点实验室, 通辽, 028043
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2018年10月16日    接受日期: 2018年11月21日    发表日期: 2019年08月15日
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摘要

磷脂酰胆碱甘油二酯胆碱磷酸转移酶(phosphatidylcholine diglyceride choline phosphotransferase, PDCT)是种子中甘油三酯(triglyceride, TAG)积累过程中不饱和脂肪酸合成所必须的酶,因此在油脂合成和积累中起着重要的作用。本研究以‘通蓖 5 号’蓖麻品种幼嫩叶片为实验材料,根据美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)上已知蓖麻 PDCT 基因(LOC8282344)及其基因组(NW-002994322)序列设计引物,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)扩增得到 PDCT 基因启动子片段。生物信息学分析 PDCT 蛋白的理化性质以及 PDCT 基因启动子序列。结果表明克隆到 PDCT 基因启动子序列 3 741 bp,分析预测有多个转录起始位点及大量的顺式作用元件;PDCT 基因共编码 285 个氨基酸,存在跨膜结构,为非分泌蛋白;对蛋白质编码的氨基酸进行同源性比对,并用 MEGA 7.0 构建了进化树,发现蓖麻和麻疯树,巴西橡胶树,木薯聚类到一起,这一分类与生物学分类一致,均为大戟科植物。对蓖麻PDCT 基因及其启动子和蓖麻油脂合成代谢途径的进一步研究提供参考。

关键词
蓖麻(Ricinus communis L.);PDCT;基因启动子;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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