毛立彦 ^* , 龙凌云 , 黄秋伟 , 唐毓玮 , 金刚 , 黄寿辉 , 谢振兴 , 於艳萍

广西壮族自治区亚热带作物研究所, 南宁, 530001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2018年09月29日    接受日期: 2018年10月08日    发表日期: 2020年05月18日

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以植物 PHT1 家族蛋白为研究对象，基于中国莲(Nelumbo nucifera)全基因组数据库，利用生物信息学方法发掘中国莲可能存在的 PHT1 家族成员，并对中国莲 PHT1 家族成员进行序列比对、系统进化、保守序列、跨膜结构、二级结构和亚细胞定位等分析。结果表明，从中国莲全基因组数据库中筛选获得 4 个 PHT1蛋白，分别命名为：NnPHT1:1、NnPHT1:2、NnPHT1:3、NnPHT1:4。它们在植物 PHT1 家族中属于 Group I，均含有保守序列：GGDYPLSATIxSE。该序列具有 11~12 个跨膜区域，且保守序列位于第 4 个跨膜区域内，均定位于细胞质膜，且在细胞内侧第 6 和第 7 个跨膜区域之间均含有一个较大的细胞胞质内环结构；磷酸化位点和糖基化位点的数量范围分别在 33~50 个和 4~9 个；二级结构中 α- 螺旋和无规卷曲结构的数量总和均高于 70%。研究结果展示了中国莲的 PHT1 家族成员的序列基本信息和结构特点，为深入研究中国莲的该家族成员基因及其编码蛋白的结构功能提供理论依据。
 

中国莲(Nelumbo nucifera)； 基因组；PHT1 家族；磷转运蛋白；生物信息学