夏瑾华 ^* , 万志庭 , 胡光明 , 廖玉 , 曾会英 , 聂学文 , 肖琴 , 尹俪陈

上饶师范学院生命科学学院, 上饶, 334001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2018年09月20日    接受日期: 2018年09月27日    发表日期: 2019年12月14日

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本研究以上饶早梨两个品种‘六月雪’和‘黄皮消’试管苗为材料，进行了转录组分析。结果表明：原始数据进行质量预处理后，BR (六月雪)组和 HR (黄皮消)组以及这两组所有样本的有效比分别为 91.60%、93.03%和 92.32%。与 HR 组相比，BR 组上调的差异基因 1 013 个，下调的差异基因 954 个，总数为 1 967 个。BR 组和 HR 组的 RPKM 分布范围均为 0~5，差异最显著的 10 个基因分别为 PCP025111、PCP026477、PCP030457、PCP027061、PCP014174、PCP007177、PCP012213、PCP023677、PCP014786 和 PCP04450。差异表达基因部分极其显著的 GO term 有氧化还原过程、铁离子结合、氧化还原酶活性、作用于成对供体、与分子氧掺入或还原、电子载体活性等。差异表达基因部分极其显著的 Pathway term 有光合作用 - 天线蛋白、植物激素信号转导、细胞色素 P450 的外源性化学物质代谢、药物代谢 - 细胞色素 P450 等。本研究结果可为上饶早梨六月雪和黄皮消两个品种的鉴定和选育提供理论依据。

上饶早梨；六月雪；黄皮消； 试管苗；转录组分析