研究报告

中间锦鸡儿 WRKY30 的克隆及生物信息学分析  

柳金华1 , 万永青1 , 刘杨2 , 王瑞刚1 , 李国婧1
1 内蒙古农业大学生命科学学院, 内蒙古自治区植物逆境生理与分子生物学重点实验室, 呼和浩特, 010018; 2 大连市食品检验所, 大连, 116630
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2018年09月14日    接受日期: 2018年10月24日    发表日期: 2019年08月15日
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摘要

为了研究 CiWRKY30 转录因子在植物应对多种胁迫中发挥重要的作用,及对植物形态发育方面的影响。本研究以生长于内蒙古干旱高原地带且具有较高的抗寒抗旱特性的中间锦鸡儿为材料,从本实验室干旱转录数据库中获得胁迫响应转录因子 CiWRKY30 核苷酸序列,NCBI 比对为全长序列,设计引物对该基因进行互补脱氧核糖核酸(complementary DNA, cDNA)克隆,测序结果显示 CiWRKY30 的开放阅读框(open reading frame, ORF)1 083 bp,编码 361 个氨基酸。然后通过生物信息学的比对分析方法,来对CiWRKY30 和其它 7 WRKY 转录因子的分子量、等电点等一级结构,及其它二三级结构加以预测。结果推测这 8 种同源性较高蛋白很可能在细胞核中发挥作用,由此得到有效信息来对接下来的功能研究起到推动作用。另外,通过对 CiWRKY30 转录因子氨基酸序列进行生物信息学分析,预测 CiWRKY30 转录因子的结构,推断其可能的功能,以及对其他同源性较高植物 WRKY 转录因子结构功能的预测都有助于我们对CiWRKY30 转录因子的研究加以深入了解。

关键词
中间锦鸡儿(Caragana intermedia);WRKY30;CiWRKY30 转录因子;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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