研究报告

黄牡丹花瓣转录组分析及不同开放阶段差异基因筛选  

周琳1 , 史倩倩1,2 , 齐宇1 , 缪崑1 , 王雁1*
1 中国林业科学研究院林业研究所, 林木遗传育种国家重点实验室, 国家林业局林木培育重点实验室, 北京, 100091; 2 西北农林科技大学风景园林艺术学院, 杨凌, 712100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2018年08月10日    接受日期: 2018年09月16日    发表日期: 2019年08月27日
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摘要

为揭示黄牡丹花色形成过程中类黄酮生物合成相关基因的表达情况,本研究以云南野生黄牡丹为材料,采用 Solexa 测序技术对不同开放阶段的花瓣总 RNA 等量混合的样品进行转录组测序,经组装共得到88 330 Unigene,平均长度为 603 bp。在此基础上,对“硬蕾期”、 “初开期”和“盛开期”的花瓣建立差异表达谱,共获得 7 790 个表达差异基因。挑选 GO 功能显著性富集和 Pathway 显著性富集分析中富集在类黄酮生物合成代谢通路的差异基因 Pl-CHS1Pl-CHI1Pl-THC2'GT Pl-5GT1 进行 qRT-PCR 表达模式验证。结果表明,随着花朵的开放和着色,Pl-CHS1 的表达量逐渐上升;而 Pl-CHI1 Pl-5GT1 的表达量迅速降低;与“硬蕾期”相比,Pl-THC2'GT 的表达量在“初开期”迅速上升,并且其高水平表达持续保持到花朵盛开。该结果与表达谱分析结果相一致。本研究为深入开展黄牡丹花色形成相关基因的克隆和功能验证提供了丰富的信息,并为揭示牡丹黄色花形成分子机制提供了帮助。

关键词
黄牡丹(Paeonia lutea);转录组;花朵开放;差异表达基因

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