研究报告

节节麦HKT基因的克隆及生物信息学分析  

甘晓龙 1,3 , 刘韬 1,3 , 刘宝龙 1,2 , 陈文杰1,2 , 张连全 4 , 刘登才 4 , 张波1,2,3* , 张怀刚1,2,3*
1 中国科学院西北高原生物研究所, 西宁, 810008; 2 中国科学院西北高原生物研究所, 青海省作物分子育种重点实验室, 西宁, 810008; 3 中国 科学院大学, 北京, 100049; 4 四川农业大学小麦研究所, 成都, 611130
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2018年09月13日    接受日期: 2015年09月23日    发表日期: 2019年12月14日
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摘要

高亲和性钾离子转运蛋白(high affinity K+ transporter, HKT)是一类普遍存在于植物体内的离子转运载体,主要负责 Na+ 运输或 Na+-K+ 协同运输,在植物耐盐和维持体内离子稳态的过程中具有重要作用。为了挖掘和预测节节麦(Aegilops tauschii)HKT 基因的序列信息和功能,通过同源克隆技术,从节节麦中获得了HKT 基因,命名为 AsHKT (GeneBank: MH457099),并对其基因序列及编码蛋白的结构、理化特性和功能进行了生物信息学分析,结果表明,AsHKT 基因的 CDS (Coding sequence)序列长度为 1 527 bp,最长开放读码框位于 1~1 527 bp 处,共编码 508 个氨基酸,分子式为:C2535H4052N662O705S29,蛋白分子量约为 56.01 kD,是疏水性蛋白,结构稳定,有明显的跨膜结构域,其二维结构的组成元件有 - 螺旋、延伸链和无规则卷曲,分别达到:37.4%17.13%45.47%,并且通过同源建模成功预测得到其三维结构。此外,系统进化分析表明,AsHKT基因与小麦 7D 染色体上的 TaHKT2;2 基因同源性最高,属于HKT 基因家族,本研究为节节麦和小麦的耐盐分子机理的解析以及节节麦 HKT 基因的进一步研究提供了参考和理论依据。

关键词
节节麦(Aegilops tauschii); HKT 基因;基因克隆; 生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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