研究报告

红肉猕猴桃果实发育期不同果肉部位比较转录组分析  

涂美艳1,2 , 李明章3 , 孙淑霞2 , 李靖2 , 陈栋2 , 宋海岩2 , 江国良2 , 廖明安1*
1 四川农业大学园艺学院, 成都, 611130; 2 四川省农业科学院园艺研究所, 农业部西南地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室, 成都,610066; 3 四川省自然资源科学研究院, 成都, 610015
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2018年09月06日    接受日期: 2018年09月16日    发表日期: 2019年02月28日
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摘要

红肉猕猴桃中果皮和内果皮在果实发育不同时期色泽变化模式有显著差异,但目前对于其内在的分子调控机制尚不清楚。本研究中,利用高通量测序技术,对红肉猕猴桃‘( 红实 2 号’)中果皮与内果皮 4 个不同发育时期(开花后 0 d, 28 d, 75 d, 157 d, 分别标注为 T1 时期, T2 时期, T3 时期, T4 时期)的样本进行转录组测序。经去除低质量数据后,得到 Clean reads 数目为 2 192~4 331 万,检测到的基因数目为 24 607~29 170 个。在(log2 Ratio)1 FDR<0.05 阈值下,中果皮和内果皮在 T2T3T4 时期检测到的差异基因数目分别为 1 880 个、4 799 个、7 346 个和 4 31 个、1 493 个、7 700 个。KEGG 分析显示这些差异表达基因被富集到 68 个代谢途径,包括 DNA 复制、RNA 转运、蛋白质输出、植物激素信号转导、类黄酮生物合成、花青素合成、淀粉与蔗糖的代谢等。此外我们还鉴定到 13 个花青素合成相关基因差异表达,大部分基因的表达量随果实的发育呈现下降趋势,这一结果与花青素含量变化模式相吻合。本研究不仅深化了对猕猴桃果实成色差异机理的认识,还对今后的彩色猕猴桃选育种工作有一定的帮助。

关键词
红肉猕猴桃;转录组;中果皮;内果皮;花青素

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《分子植物育种》印刷版
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