研究报告
基于高分辨率熔解曲线的银杏 SNP 分型方法构建 
吴雅琼 
,
辛月 ,
王建文 ,
祁铭 ,
荣浩 ,
徐立安* 
,
辛月 ,
王建文 ,
祁铭 ,
荣浩 ,
徐立安*
南京林业大学, 南方现代林业协同创新中心, 南京, 210037
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 30 篇
收稿日期: 2018年09月06日 接受日期: 2018年09月16日 发表日期: 2019年08月28日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 30 篇
收稿日期: 2018年09月06日 接受日期: 2018年09月16日 发表日期: 2019年08月28日
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摘要
本研究旨在探究利用高分辨率熔解曲线(HRM)进行银杏 SNP 分型的最优体系。试验结果表明：使用Forget-Me-NotTMqPCR Master Mix Eva Green 染料(10μL 反应体系)，引物浓度为 0.1μmol/L，DNA 浓度 2.5 ng/μL情况下，银杏 SNP 分型能取得较好的区分效果。结果显示本体系有高通量、方便快捷和经济实用等优势。本研究建立的银杏 SNP 基因分型体系适合一次试验对单位点、多个体情况下的 SNP 鉴定和快速分型。利用优化的 HRM 体系，从银杏转录组数据中筛选获得了 22 个阳性 SNP 位点，并在 3 个银杏地区(90 个个体中)进行了分型验证。该方法将在林木遗传图谱构建、品种鉴别、遗传多样性研究等方面有广泛应用前景。
关键词
银杏(Ginkgo biloba L.)；高分辨率熔解曲线；单核苷酸多态性；基因分型
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