研究报告

毛华菊CvCRY2基因的克隆、生物信息学及表达分析  

朝峰 , 邓成燕 , 戴思兰*
北京林业大学园林学院, 花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室, 国家花卉工程技术研究中心, 城乡生态环境北京实验室, 林木花卉遗传育种教育部重点实验室, 北京, 100083
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2018年09月24日    接受日期: 2018年09月20日    发表日期: 2019年12月14日
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摘要

蓝光受体隐花色素(Cryptochromes)在高等植物开花时间调控中发挥重要作用。结合毛华菊转录组数据库,利用 RACE 技术克隆得到毛华菊 CRY2 基因,命名为 CvCRY2,并对该基因及其蛋白进行了生物信息学和表达模式分析。结果显示,CvCRY2 基因编码区全长为 1 839 bp,共编码 613 个氨基酸,预测蛋白相对分子量为 69.954 kD,理论等电点(pI)5.69,为亲水性蛋白。同源氨基酸序列比对结果表明,CvCRY2 与甘菊、青蒿等功能已确认的 CRY2 同源性较高,氨基酸序列相似性均达 80%以上,与拟南芥 AtCRY2 的相似性为 56.82%;系统进化分析表明 CvCRY2 蛋白与甘菊、青蒿亲缘关系更近;CvCRY2 蛋白功能结构域分析表明其具有高度保守 DNA photolyase 区域和 FAD_binding_7 结构域。CvCRY2 蛋白二级结构中 - 螺旋占38.66%和无规则卷曲占 46.49%。利用 qRT-PCR 技术对毛华菊根、茎、叶、蕾、花和顶芽等组织器官中CvCRY2 基因表达进行相对定量分析,发现 CvCRY2 在叶片中的表达量最高,其次是茎尖、茎、花、花蕾,在根中的表达量最低。CvCRY2 响应短日照处理的表达模式分析发现该基因表达丰度受短日照的影响。随着短日照诱导时间的延长,其表达丰度逐渐升高,在短日照诱导 16 d 时出现一个表达高峰。本研究可为毛华菊CvCRY2 基因的功能解析及调控机制研究提供参考。

关键词
毛华菊(Chrysanthemum vestitum);隐花色素; 开花时间

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《分子植物育种》印刷版
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