研究报告

基于高通量测序的大叶女贞(Ligustrum lucidum)转录组分析  

徐伟君1 , 张九东1 , 郑博文2 , 白群伟2
1 西安文理学院生物与环境工程学院, 西安, 710065; 2 陕西师范大学生命科学学院, 西安, 710119
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2018年08月29日    接受日期: 2018年10月08日    发表日期: 2019年10月17日
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摘要

为研究大叶女贞功能基因的序列信息和表达状况,以幼嫩叶片为材料,利用 Illumina HiSeqTM 2500高通量测序技术对其进行转录组测序,通过序列拼接组装得到 192 392 个单基因簇(Unigene),平均长度为821 bpNR 库和 Swiss-Prot 库分别注释了 88 896 61 783 Unigene。在 GO 分子功能、生物过程和细胞组分 3 大类中分别注释了 12 91412 859 7 644 个基因,其中以分子功能注释最多,占 38.64%;以细胞组分较少,为 22.87%。本研究获得的转录组数据将为大叶女贞功能基因挖掘与利用和其种质资源遗传改良等方面的研究提供参考。

关键词
大叶女贞(Ligustrum lucidum);转录组;高通量测序;基因注释

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《分子植物育种》印刷版
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