研究报告

上饶早梨全基因组重测序和转录组的关联分析  

尹明华* , 吴平华 , 刘邦旺 , 胡光明 , 王钦 , 张红蕾
上饶师范学院生命科学学院, 上饶, 334001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2018年08月27日    接受日期: 2018年09月05日    发表日期: 2019年07月09日
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摘要

本研究对上饶早梨两种品种‘花厅六月雪’(BR)和‘花厅黄皮消’(HR)的全基因组重测序和转录组进行关联分析。结果表明:在进行差异 InDel 分析后,共有 3 682 个候选基因与转录组数据进行了关联分析;在CV 分析后,共有 2 067 个候选基因与转录组数据进行了关联分析;在进行 CNV 分析后,与转录组差异基因数据进行了关联分析,其中分类为 amplification CNV 中,属于显著差异的,并且倍性变化2 倍的 CNVBR相对于 HR 79 个上调,42 个下调;分类为 deletion CNV 中,属于显著差异的,并且倍性变化2 倍的CNVBR 相对于 HR 149 个上调,193 个下调;分类为 neutral CNV 中,属于显著差异的,并且倍性变化2 倍的 CNVBR 相对于 HR 199 个上调,196 个下调。本试验结果可为上饶早梨两种品种‘花厅六月雪’(BR)和‘花厅黄皮消’(HR)的品种鉴定和品种选育提供理论依据。

关键词
上饶早梨;全基因组重测序;转录组;关联分析

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《分子植物育种》印刷版
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