研究报告

龙眼 Dlf3h 基因的克隆、表达及其生物信息学分析  

郑威1,2* , 董学明1 , 张秋颖1 , 于雪飞1 , 陈宁1 , 季宇彬 1 , 李文兰2
1 哈尔滨商业大学, 生命科学与环境科学研究中心, 哈尔滨, 150076; 2 哈尔滨商业大学药学院, 哈尔滨, 150076
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2018年08月10日    接受日期: 2018年08月23日    发表日期: 2019年08月27日
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摘要

本研究应用聚合酶链式反应(PCR)技术对龙眼黄烷酮 -3- 羟化酶基因(Dlf3h)进行克隆;运用实时荧光定量 PCR (Quantitative real time PCR)技术对 Dlf3h 基因在龙眼根、茎、叶组织中的表达进行分析;采用生物信息学方法对 Dlf3h 蛋白理化性质、信号肽、亚细胞定位、亲疏水性、二级结构、三级结构等进行预测。结果表明:成功克隆获得一条长度为 1 098 bp Dlf3h 基因,由 366 个氨基酸组成;该基因在根中表达量最高,其次为叶,在茎中表达量最低;生物信息学分析表明 Dlf3h 没有信号肽和跨膜结构,是一种可溶性亲水蛋白,定位于细胞核内;二级结构元件主要由 α- 螺旋和无规则卷曲组成,具有卷曲螺旋;Ramachandran 评估表明应用 SWISS-MODEL 构建的三级结构模型可靠,其配体结合位点为 217 His 275 His。本研究结果为进一步研究龙眼类黄酮合成的分子调控机制提供依据。

关键词
龙眼(Dimocarpus longan);Dlf3h;生物信息学分析;基因克隆;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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