张加强 ^* , 刘慧春 , 朱开元 , 周江华 , 谭晨

浙江省萧山棉麻研究所, 杭州, 311202
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2018年08月20日    接受日期: 2018年08月30日    发表日期: 2019年12月14日

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本研究以油用牡丹的脂肪酸脱氢酶 FAD3 基因为研究对象，运用 Codon W 和 CUSPS 等研究 FAD3基因的密码子使用偏好性及组成特征。研究表明，油用牡丹 FAD3 基因的 ENc 值为 55.58，该基因密码子选择偏性较弱，GC 含量为 0.457，密码子第 3 位碱基的 GC 含量为 0.420，油用牡丹 FAD3 基因有 18 个偏好使用的密码子，其中约 72.22% (13 个)的密码子以 A/T 结尾；聚类结果分析表明，基于 FAD3 基因密码子相对使用度 RSCU 和 CDS 序列的分类结果一致，均能将单子叶植物和双子叶植物区分开；与大肠杆菌、酵母、拟南芥和烟草的基因组密码子使用偏好性比较，油用牡丹与烟草基因组密码子的使用偏性更为接近，烟草更适合作为 FAD3 转基因的受体。本研究结果为 FAD3 基因选择适合的受体和提高该基因的表达水平提供参考依据。

油用牡丹； 脂肪酸脱氢酶；密码子偏好性；聚类分析