研究报告

花叶唐竹 4 种叶色表型 qRT-PCR 内参基因筛选  

陈凌艳1 , 谢德金2 , 荣俊冬2 , 何天友1 , 郑郁善1,2
1 福建农林大学园林学院, 福州, 350002; 2 福建农林大学林学院, 福州, 350002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2018年08月17日    接受日期: 2018年09月19日    发表日期: 2019年08月15日
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摘要

本研究结合花叶唐竹(Sinobambusa tootsik f. luteoloalbostriata)不同叶色表型的转录组数据,利用荧光定量 PCR 技术筛选适合于花叶唐竹叶片的内参基因。参考传统内参基因并结合转录组数据,筛选出 7 个候选内参基因,分别是 Elongation factor 1-alpha (EF1a)Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH)Ubiquitin extension protein (UBI)S-adenosylmethionine decarboxylase (SAM)TIP41-like family protein (TIP41)Nucleotide tract-binding protein (NTB)ABA Hypersensitive 1 (ABH1)。应用 qRT-PCR 技术对这 7 个候选内参基因在花叶唐竹 4 种叶色表型中的表达情况进行检测,并利用 BestKeeperGeNorm 以及 NormFinder 3 种软件计算并分析了 7 个候选内参基因在花叶唐竹不同叶色表型中的表达稳定性。结果表明:GAPDHEF1aSAM 3 个基因的表达最为稳定、ABH1 的稳定性最差;分别以 GAPDHEF1a SAM 3 个基因为内参,分析了 PsbA 基因在花叶唐竹 4 种叶色表型中的相对表达量,结果显示趋势一致,从而验证了 GAPDHEF1a SAM 的表达稳定性,这 3 个基因均可作为花叶唐竹 qRT-PCR 技术验证表达量的内参基因。该研究为花叶唐竹叶色表型差异的分子机理研究提供了科学依据。

关键词
花叶唐竹;内参基因;实时荧光定量 PCR

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《分子植物育种》印刷版
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