研究报告

植物赤霉素氧化酶 GA20ox 基因的生物信息学分析  

张加强* , 刘慧春 , 周江华 , 谭晨 , 朱开元
浙江省萧山棉麻研究所, 杭州, 311202
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 19 篇   
收稿日期: 2018年08月09日    接受日期: 2018年09月23日    发表日期: 2019年08月27日
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摘要

在植物发育和生理过程中,GA-20 氧化酶(GA-20 oxidase, GA20ox)起着非常重要的调控作用。运用生物信息学的方法,对 27 种不同植物的 GA20ox 基因的氨基酸序列的基本理化参数进行预测和分析,并构建其系统进化树。结果表明,植物 GA20ox 的蛋白质序列长度在 345~426 aa 之间,分子量在 39.23~49.15 kD之间,等电点在 5.09~7.65 之间,大多数植物的 GA20ox 蛋白呈酸性、蛋白较为稳定、表现为亲水性、定位于细胞核中、具有多个功能位点(包括磷酸化位点和糖基化位点)27 种不同植物的含有 5 个保守基序,其中 Motif 1Motif 2 2OG-FeII_Oxy 域,Motif 3 DIOX_N 域;基于氨基酸序列的系统聚类结果与物种间的亲缘关系远近相一致,具有明显种属特征;GA20ox 蛋白二级结构以无规则卷曲和α- 螺旋为主要元件。该研究结果对深入解析植物 GA20 的生物学功能及 GA 调控机理具有重要意义,为以后植物定向改良育种实践提供理论参考。

关键词
生物信息学;赤霉素;GA-20 氧化酶;休眠与萌发

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《分子植物育种》印刷版
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