研究报告

紫色马铃薯 sAGP 基因的克隆及其生物信息学分析  

何姗 , 申蕾阳 , 青芸 , 吴楠 , 黄玉碧 , 余国武*
四川农业大学农学院, 成都, 611130
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2018年08月13日    接受日期: 2018年08月17日    发表日期: 2019年08月27日
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摘要

腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)是植物内淀粉合成的限速酶。sAGP 基因编码 AGPase 的小亚基。本研究使用同源克隆法,以 NCBI 中已知马铃薯 sAGP 基因(GenBank: AY186620.1)序列设计引物,克隆紫色马铃薯‘蓉紫芋 5 号’的 AGPase 小亚基基因 sAGP 的编码区序列。结果显示,克隆的序列与普通马铃薯一致性达 99%,成功获得了紫色马铃薯的 cDNA;该片段具有一个 1 425 bp 的开放阅读框,编码 475 个氨基酸残基;预测蛋白质分子量为 52.43 kD,等电点为 6.23sAGP 同源性分析表明紫色马铃薯与番茄、辣椒、烟草的同源性均达到 90%以上。用氨基酸序列构建三维模型,发现克隆得到的 sAGP 包含 10 α螺旋,25β折叠,并存在 NTP transferase domain pbH1 两个结构域,符合 NTP 转移酶家族特征,推测其为 AGPase 小亚基。本研究克隆了紫色马铃薯 sAGP 基因并对其序列特征进行了初步分析,为今后进一步了解研究紫色马铃薯中的淀粉合成机制提供了科学依据。

关键词
紫色马铃薯;AGPases;sAGP;克隆

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《分子植物育种》印刷版
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