研究报告

枣 TCP 转录因子鉴定与生物信息学分析  

陈国梁1,2* , 祖欢欢 1 , 薛宝平1 , 任彤1 , 何亚蓉1
1 延安大学生命科学学院, 延安, 716000; 2 陕西省红枣重点实验室, 延安, 716000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2018年07月10日    接受日期: 2018年08月10日    发表日期: 2019年05月22日
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摘要

TCP 蛋白家族是一类植物特有的转录因子家族,在参与植物进化与发育方面起着至关重要的作用。枣基因组测序的完成为本实验提供了基础。本研究中,共鉴定到 24 个枣 TCP 基因。利用生物信息学方法对其基因分类、染色体定位、系统进化、基因结构和保守基序进行分析。系统发育表明分为 3 个家族:Group1Group2 Group3Group2 Group3 位于进化树的同一分支。不同的基因在染色体上的定位呈不均匀分布。枣 TCP 转录因子家族在同一亚族中具有相似的基因结构和相同的保守基序。该研究初步明确了枣TCP 转录因子家族成员进化关系和结构特点,为进一步研究枣 TCP 转录因子家族的系统发育以及生物学功能提供了理论基础,为枣的分子育种提供科学依据。

关键词
枣;TCP;转录因子;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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