1 南京林业大学南方现代林业协同创新中心, 南京, 210037; 2 南京林业大学生物与环境学院, 南京, 210037
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 24 篇
收稿日期: 2017年08月07日 接受日期: 2017年09月12日 发表日期: 2019年02月20日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 24 篇
收稿日期: 2017年08月07日 接受日期: 2017年09月12日 发表日期: 2019年02月20日
© 2019 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要
本研究采用 L9(23)正交试验设计确定短丝木犀的 SSR-PCR 最佳反应体系,同时设置 12 个不同的温度梯度优化引物退火温度;利用优化后的体系以 50 对候选 SSR 引物为对象,对 6 个短丝木犀基因组DNA 样品等量混合,进行 PCR 扩增筛选引物。结果表明,第一,短丝木犀 SSR-PCR 最优反应体系为:1.0 滋L 50ng/滋L 模板 DNA,1.0 滋L 100 滋mol/L 引物,12.5 滋L 2伊Taq PCR Master Mix,补 ddH2O 至 25 滋L;第二,DNA 混合池方法比常规的筛选方法具有效率高,实验资源消耗低的优点,可用于短丝木犀 SSR 引物的大量筛选;第三,最终筛选出 10 对具有高多态性、高稳定性且重复性好的 SSR 引物。本研究旨在建立适合短丝木犀的SSR-PCR最佳反应体系,并以 DNA 混合池为模板进行引物筛选,为短丝木犀引物的大量开发提供了一种新的途径。
关键词
短丝木犀;SSR-PCR;优化;引物筛选;基因组 DNA 混合池
HTML格式版本正在制作中。