研究报告

短丝木犀 SSR-PCR 反应体系优化及基于 DNA 混合池的引物快速筛选  

钱慧蓉1,2 , 陈林1,2 , 杨国栋1,2 , 潘婷婷1,2 , 王贤荣1,2
1 南京林业大学南方现代林业协同创新中心, 南京, 210037; 2 南京林业大学生物与环境学院, 南京, 210037
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 24 篇   
收稿日期: 2017年08月07日    接受日期: 2017年09月12日    发表日期: 2019年02月20日
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摘要

本研究采用 L9(23)正交试验设计确定短丝木犀的 SSR-PCR 最佳反应体系,同时设置 12 个不同的温度梯度优化引物退火温度;利用优化后的体系以 50 对候选 SSR 引物为对象,对 6 个短丝木犀基因组DNA 样品等量混合,进行 PCR 扩增筛选引物。结果表明,第一,短丝木犀 SSR-PCR 最优反应体系为:1.0 L 50ng/滋L 模板 DNA1.0 L 100 mol/L 引物,12.5 L 2Taq PCR Master Mix,补 ddH2O 25 L;第二,DNA 混合池方法比常规的筛选方法具有效率高,实验资源消耗低的优点,可用于短丝木犀 SSR 引物的大量筛选;第三,最终筛选出 10 对具有高多态性、高稳定性且重复性好的 SSR 引物。本研究旨在建立适合短丝木犀的SSR-PCR最佳反应体系,并以 DNA 混合池为模板进行引物筛选,为短丝木犀引物的大量开发提供了一种新的途径。

关键词
短丝木犀;SSR-PCR;优化;引物筛选;基因组 DNA 混合池

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《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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