张文香^1,2 , 王自布^1,2* , 钱长江 ¹ , 黄娟³

1 贵州师范学院生物科学学院, 贵阳, 550018; 2 贵州师范学院药用植物生物技术研究所, 贵阳, 550018; 3 贵州师范大学荞麦产业技术研究中心,贵阳, 550001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2018年05月24日    接受日期: 2018年06月26日    发表日期: 2019年01月16日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

MYB 基因是一类大的转录因子家族，广泛参与植物的各种生命活动，但是杜鹃中关于此类转录因子的研究甚少，为杜鹃的分子育种提供基因资源，本研究在全基因组范围对马缨杜鹃 MYB 基因进行鉴定与分析。以马缨杜鹃基因组数据为基础，通过本地 blast 和 HMMER search，全面鉴定 MYB 转录因子，通过MEME、HMMSCAN 以及 blastn 比对，去除不含 MYB 结构域或者 MYB 结构域不完整的序列，以及冗余序列，通过 Weblogo 在线工具对 R2 和 R3 的保守基序进行分析，通过 MEGA6 分析了马缨杜鹃与拟南芥 2R-MYB基因的进化关系。得到 4 条 3R-MYB 基因、81 条 2R-MYB 基因、85 条 1R-MYB 基因，保守基序分析发现马缨杜鹃 MYB 基因的 R2 和 R3 结构域具有典型的保守色氨酸残基和 3 个 琢 螺旋结构，进化树分析将马缨杜鹃2R-MYB 基因分为了 29 个亚组，基因复制分析发现有两对基因是复制关系。本研究获得的 MYB 基因序列和进化树分析，为马缨杜鹃甚至杜鹃属植物的 MYB 基因的功能研究提供了科学依据。
 

马缨杜鹃；MYB；全基因组；生物信息学