研究报告

基于RNA-Seq SSR标记的沙棘种质遗传多样性和群体遗传结构分析  

李贺1,2 , 阮成江2 , 王莉2 , 李景滨2 , 郭海3 , 田兴军1*
1 南京大学生命科学学院, 南京, 210023; 2 大连民族大学, 资源植物研究所, 大连, 116600; 3 高原圣果沙棘制品有限公司, 北京, 100038
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 25 篇   
收稿日期: 2018年05月18日    接受日期: 2018年05月23日    发表日期: 2019年03月27日
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摘要

沙棘是中国重要的生态经济植物,遗传多样性分析对于其种质资源的评价与保存十分重要。现以80 个沙棘品种/品系为试材,利用 17 对多态性的 RNA-Seq SSR 引物,研究其遗传多样性和群体遗传结构。17 SSR 引物共扩增出 50 条谱带,其中多态性谱带 41 条,每个位点条带数在 2~5 之间;多样性指数(PIC)介于 0.150 7~0.588 6,平均 0.271 0。利用 PowerMarker 3.25 UPGMA 方法进行聚类分析。结果显示,供试材料可分为两大类群,蒙古沙棘(ssp. mongolica)和杂交品种/品系聚为一个类群,中国沙棘(ssp. sinensis)构成另外一个类群。群体遗传结构分析中所有种质也被分成两个类群,杂交品种/品系介于中国沙棘和蒙古沙棘之间,与中国沙棘聚为一个类群。这些结果表明,沙棘的遗传多样性与它们的来源和遗传背景相符,可为沙棘种质资源保存和分子标记辅助育种提供理论依据。

关键词
沙棘; SSR 标记;遗传多样性; 群体结构

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《分子植物育种》印刷版
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